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如果苹果手机上的短信已经被删除，恢复它们可能会有些困难，但并非不可能。以下是一些可以尝试的方法。
1、从备份中恢复：
如果开启了iCloud备份或iTunes备份，可以通过恢复备份来找回已删除的短信，进入iPhone的设置 > 通用 > 还原 > 从iCloud备份恢复或从iTunes备份恢复，选择最近的备份进行恢复，需要注意的是，这将会覆盖当前手机的所有数据，所以在操作之前请确保备份了所有重要数据。
2、使用第三方软件恢复：
市面上存在一些第三方数据恢复软件，如EaseUS, iMyFone等，这些软件可以扫描iPhone并尝试找回已删除的短信，这些软件通常需要连接iPhone到电脑进行操作，并且可能需要付费，请注意选择信誉良好的软件，并按照软件的说明进行操作。
3、直接从运营商那里恢复：
如果短信是在运营商服务器上删除的，可以尝试联系运营商看是否可以恢复，但这通常需要提供手机IMEI号和其他相关信息，并且可能需要支付一定的费用。
4、检查删除前的短信备份或导出文件：
如果在删除短信之前已经将其导出或备份到电脑或其他设备上，可以从这些文件或备份中恢复短信。
无论使用哪种方法，恢复已删除的短信都需要尽快行动，因为数据被覆盖的风险随着时间的推移而增加，以上方法不能保证一定能够恢复所有已删除的短信，因此建议定期备份手机数据以防万一，如果无法自行恢复，可以咨询苹果官方客服寻求帮助。